江西农业大学学位与研究生教育始于1962年，是江西省开展研究生教育最早的高校，是我国首批具有硕士学位授予权单位之一。先后获得推荐免试攻读硕士学位、在职人员以研究生毕业同等学力申请硕士学位、在职人员攻读硕士专业学位，2003年学校获博士学位单位。六十多年来，先后招收各级各类研究生1.6万余人，已授予博士、硕士学位12187人。

学校现有1个国家林业和草原局重点学科，4个江西省一流学科，9个一级学科博士点，1个专业学位博士点，21个一级学科硕士点，12个专业学位硕士点，5个博士后科研流动站，ESI全球排名前1%学科6个。

学校师资力量雄厚。拥有一支素质较高、结构合理的研究生导师队伍。现有博士生导师139人，硕士生导师697人，省高校金牌研究生导师4人。以两位中国科学院院士为代表的国家级人才108人次、省部级人才291人次。拥有在国际上有重要影响的动物遗传学研究团队、保护生物学研究团队，及“全国高校黄大年式教师团队”1个，国家、省级教学团队27个、部省级创新团队7个。

学校科技创新体系特色鲜明。现有全国生猪领域唯一、江西首个独立组建的猪遗传改良与种质创新全国重点实验室，同时拥有国家工程实验室、国家地方联合工程实验室、教育部重点实验室、农业农村部重点实验室、教育部国际合作联合实验室、自然资源部工程技术创新中心、林业和草原局重点实验室（工程技术中心），江西省重点实验室（工程技术研究中心）、江西省重大科技创新平台预备队、工程实验室（研究中心）、产教融合重点创新中心、国家级协同创新中心、省级协同创新中心等国家级、部省级科技创新平台45个；拥有全省唯一高校新农村发展研究院；拥有省级重点智库等人文社科研究平台6个。